Juliane Schäfer
大白话:慕尼黑大学统计系学者。她与 Korbinian Strimmer 合著的 Schäfer-Strimmer 2005(SAGMB 4(1), Article 32)把 Ledoit-Wolf (2003) 的解析收缩强度 落地成闭式的协方差 / 相关估计量,用来推断功能基因组学的基因关联网络 (GGM); 并提出 local-fdr 的边级模型选择,给出「收缩 GGM > lasso > bootstrap > 伪逆」的实证排序。
与量化相关的核心工作
- 2005 SAGMB*** —— *A Shrinkage Approach to Large-Scale Covariance Matrix Estimation and Implications for Functional Genomics。 首次把 LW (2003) 的引理 1 **完整代入经验方差,目标矩阵 D(对角且不等方差) 使 S_\star 总是正定、并自动兼容 n\ll p。 在 p=102, n=8 的 E. coli 数据中,S 的秩只有 8,而 S_\star 的秩是 102、条件数 386.6。
- **2005 Bioinformatics***(Schäfer & Strimmer 2005a)—— *An Empirical Bayes Approach to Inferring Large-Scale Gene Association Networks。 GGM 选择的经验贝叶斯混合框架(Hotelling 1953 的精确零分布 + Efron 的 locfdr)。
- **2005 AIP Conf. Proc.***(Schäfer & Strimmer 2005b)—— *Learning Large-Scale Graphical Gaussian Models from Genomic Data。 Science of Complex Networks 776, 263-276。
工程贡献
- R 包 corpcor(Computing Correlation and Partial Correlations):LW 收缩协方差 / 相关 + (偏)相关计算,GPL 许可,CRAN 长期维护。
- R 包 GeneTS(Gene Targeting System / Genomic Time Series):microarray 数据的 GGM 推断与可视化, Bioconductor 与 CRAN 双发布。
相关页面
- entities/Korbinian Strimmer —— 合作者,同属 LMU 统计系
- entities/Schäfer Strimmer 2005 Shrinkage Covariance Genomics —— 本文
- concepts/models-theory/Covariance Shrinkage Estimation —— 核心方法所属
- concepts/models-theory/Graphical Gaussian Models —— GGM 概念页
- summaries/200503-a-shrinkage-approach-to-large-scale-covariance-matrix-estimation/200503-a-shrinkage-approach-to-large-scale-covariance-matrix-estimation —— 中文摘要